一、疫病
　　是韭菜的重要病害，还可危害葱、蒜等作物。主要危害假茎和鳞茎，叶片、花类、根也可被害。患部初呈暗绿色水渍状斑，当病斑扩展到叶片的一半时，呈湿腐、叶、薹下垂。鳞茎受害，根盘处呈水渍状浅褐色至暗绿色腐烂。根部受害，根毛少，变褐腐烂。湿度大时，病部长出白色稀疏霉层。高温(25—32℃)、高湿(相对湿度在95%以上)是该病发生的重要条件。连作、地势低洼积水、土壤粘重等发病重。其防治方法如下：
　　1、农业防治：轮作；深沟高畦种植；合理排灌；施足基肥，实行配方施肥；注意田间卫生。
　　2、药剂防治：发病初期，用90%乙磷铝800倍液+高锰酸钾1000倍液，或58%瑞毒霉锰锌可湿粉500倍液，或25%瑞毒霉可湿粉800倍液，或64%杀毒矾可湿粉600倍液，或65.5 %普力克水剂800倍液，或69%安克锰锌+75%百菌清(1：1)1 000 倍液，间隔7—10天1次，根据病情喷2—3次。
　　
　　二、锈病
　　主要危害韭菜、大葱、洋葱，而韭菜更易受害。该病主要危害叶片和花梗，初在患部出现纺锤形或椭圆形隆起的橙黄色小疱斑，后扩展为较大疱斑。表皮破裂散出橙黄色粉状物，后期患部现黑色疱斑，破裂后散出黑粉。病情严重时，病斑布满叶片两面，似铁器生锈，失去食用价值。偏施过氮肥、地势低洼多温、排水不良，都有利于该病发生和流行。其防治方法如下：
　　1、农业防治：施足有机肥，增施磷钾肥，合理排灌，提高植株抵病力。及时摘除病叶，清除病残体并烧毁。
　　2、药剂防治：发病初期喷施15%，粉锈宁2000倍液，或40%硫磺悬浮剂400倍液，或25%敌力脱乳油3000倍液，或25%敌力脱乳油+15%粉锈宁可湿粉(1：2)4 000 倍液，或70%代森锰锌+15%粉锈宁可湿粉(2：1)2 000 倍液，隔7—10天喷1次，根据病情喷1—3次，要特别注意对发病中心的防治。
　　
　　三、菌核病
　　主要危害韭菜的叶鞘、叶片和假茎。而大葱、洋葱被害部位主要为叶片和花梗。被害部均呈褐色或灰褐色湿腐状，后腐烂干枯，田间可见或片枯死株，被害部可见棉絮状菌丝缠绕及由菌丝纠结而成的黄白色主茶褐色菜籽状小菌核。温暖多湿的天气有利发病，地势低洼积水、偏施、过施氮肥，种植过密通风不良等均会加重发病。其防治方法如下：
　　1、农业防治：播种前选种，除去菌核。合理轮作，合理密植，加强肥水管理，注意田间卫生，清除病残物，减少菌源。
　　2、药剂防治：发病初期，若韭菜则在每次割韭后到新株抽生期可交替喷施50%速克灵可湿粉1500倍液，或50%农利灵可湿粉1000倍液，或50%扑可因可湿粉1000倍液，或40%菌核净可湿粉700—1000 倍液，或用世高1000倍液，交替喷施3—4次，7—10天1次，喷施淋施相结合效果更好。
　　
　　四、霜霉病
　　是大葱、洋葱的常见病害，主要危害叶片及花梗，被害部呈灰绿色(洋葱)至黄白色(大葱)卵圆形病斑，边缘不明显。潮湿时患部表面遍生白色绒霉，后呈暗紫色霉层。日暖夜凉、多雨或多浓雾露，有利病害的发生。连作地、地势低洼的积水田块发病严重。其防治方法如下：
　　1、选用抗病品种：一般洋葱红皮比黄皮抗病，黄皮比白皮抗病。
　　2、种子、种苗消毒：种子消毒可用50℃温水浸25分钟；鳞茎或侧生苗可用45℃温水浸90分钟，即用冷水冷却后晾干播种。或用50%福美双+35%瑞毒霉(1：1)可湿粉拌种。
　　3、农业防治：深沟高畦种植，实行轮作，施足有机质肥及磷钾肥，合理密植及排灌，及时剔除病苗、病株，注意田间卫生。
　　4、药剂防治：发病初期，及时喷施90%乙磷铝800倍液+高锰酸钾1000倍液，或25%瑞毒霉可湿粉800倍液，或58%瑞毒霉锰锌600倍液，或75%百菌清可湿粉600倍液，或64%杀毒矾可湿粉500倍液，或72%克露可湿粉600倍液，或69%安克锰锌+75%百菌清可湿粉(1：1)1 200 倍液，隔7—10天喷1次，连喷3—4次，注意交替喷施。